انتقال مرحله بلاستوسیست در روش انتقال بلاستوسیست، جنین‌هایی که در مرحله‌ی بلاستوسیست قرار دارند، به جای ۲ الی ۳ روز مانند IVF مرسوم، به مدت ۵ الی ۶ روز در آزمایشگاه کشت داده می‌شوند.
در واقع در این روش یک مزیت حیاتی با اجازه دادن به جنین‌ها برای ادامه این مرحله از رشد قبل از انتقال جنین به دست می‌آید، زیرا این یک فرآیند انتخاب طبیعی است و به ما نشان می‌دهد که کدام جنین قوی‌ترین است و بهترین شانس موفقیت را دارد.
همچنین در لقاح طبیعی، جنین در لوله فالوپ بارور می‌شود و تا مرحله بلاستوسیست به رحم نمی‌رسد. از این رو انتقال بلاستوسیست ممکن است بیشتر با چرخه طبیعی زن همگام شود. انتقال بلاستوسیست با نرخ لانه گزینی بالاتر ارتباط دارد.